Data Tables & Customization¶
Working with Data Tables¶
플랫폼 전반에서 데이터 테이블은 시각화 아래에 펼칠 수 있는 섹션으로 제공됩니다. 오른쪽에 접기/펼치기 chevron(화살표)이 있는 헤더로 표시됩니다.
Expanding a table¶
테이블 헤더 행(예: "GO Enrichment Table", "Z-score Table", "PC Scores", "Genes — All", "KEGG Enrichment Table")의 아무 곳이나 클릭하면 열림/닫힘이 전환됩니다.
Table features¶
- 테이블은 위쪽 플롯에 해당하는 데이터의 행과 열을 표시합니다.
- 넓은 테이블에서는 가로로 스크롤하여 모든 열을 볼 수 있습니다.
- 세로로 스크롤하여 모든 행을 볼 수 있습니다.
- 열 헤더는 각 열의 데이터를 설명합니다(예: gene_id, 샘플 이름, PC scores, 상관값).
Tip
데이터 테이블은 플롯에서 본 특정 값을 확인하거나 관심 있는 개별 유전자 또는 샘플을 식별하기에 좋은 방법입니다.
Customizing Plots¶
Liragen Insights는 sidebar를 통해 플롯 외형을 완전히 제어할 수 있습니다. 다음은 일반적인 사용자 지정 워크플로입니다.
Adjusting Significance Thresholds¶
- sidebar의 Filters 섹션에서 Adjusted p-value threshold 슬라이더를 드래그하여 원하는 유의성 기준값을 설정하세요(예: 표준 기준의 경우 0.05, 더 엄격한 기준의 경우 0.01).
- log2 Fold Change threshold 슬라이더를 드래그하여 생물학적으로 의미 있다고 판단하는 최소 fold change를 설정하세요.
- Top N 슬라이더를 사용하여 enrichment 차트에 표시되는 상위 항목의 개수를 제어하세요.
- 모든 플롯이 새 임계값을 반영하여 자동으로 업데이트됩니다.
Focusing on Specific Genes¶
- Filter by gene ID를 사용하여 모든 시각화를 특정 유전자 집합으로 좁히세요.
- 또는 Filter by gene desc를 사용하여 기능 설명 키워드로 필터링하세요.
- 다른 유전자를 제거하지 않고 특정 유전자를 강조 표시하려면 Highlight gene ID 또는 Highlight genes desc를 사용하세요.
Changing Plot Appearance¶
- sidebar에서 Appearance 섹션을 펼치세요(헤더를 클릭하여 전환).
- 산점도 데이터 포인트에 대한 Dot Size를 조정하세요.
- 차트 크기에 대한 Plot Height와 Plot Width를 조정하세요.
- Colors 견본을 클릭하여 Up, Down, Select, Others, Title, BG 또는 Axis 색상을 사용자 지정하세요.
- 텍스트 스타일링을 위해 Font size와 Font color를 조정하세요.
- Volcano plot의 기준선에 대한 Threshold Lines 유형과 색상을 변경하세요.
Resetting All Customizations¶
Appearance 섹션 하단의 "Reset to defaults" 버튼을 클릭하면 모든 설정이 원래 값으로 복원됩니다.