Contrast Scatter — Compare Two Contrasts

화면 헤더: Contrast Scatter: Cross-Contrast Comparison

Contrast Scatter 리포트는 두 contrast의 fold change를 직접 비교합니다. 두 결과 파일을 gene ID 기준으로 병합한 뒤, 공유되는 각 유전자의 contrast A에서의 log2FC(x축)를 contrast B에서의 log2FC(y축)에 대해 플롯합니다.

Reading the Plot

유전자는 두 contrast에서 어떻게 동작하는지에 따라 분류됩니다.

• Concordant — 두 contrast에서 같은 방향으로 변화(대각선을 따라 분포하는 점).
• Discordant — 반대 방향으로 변화(반대 대각선상에 분포하는 점).
• One significant — 두 contrast 중 하나에서만 유의함.

대각선에서 멀리 떨어진 점은 조건에 특이적인(condition-specific) 반응을 드러냅니다.

When to use it

"유전자가 treatment A와 treatment B에 동일한 방식으로 반응하는가?"라는 질문에 답하기 위해, 즉 두 treatment, 두 시점, 또는 두 조직을 비교할 때 Contrast Scatter를 사용하세요. 한 번에 셋 이상의 contrast를 비교하려면 Enrichment Compare 또는 Upset을 사용하세요.