Volcano — Differential Expression Analysis

화면 헤더: Volcano Plot: Differential Expression Analysis

Volcano plot은 차등 발현(differential expression) 결과를 위한 기본 시각화입니다. 모든 유전자를 점으로 플롯하며, x축은 log2 Fold Change(발현 차이의 크기)를, y축은 -log10 Adjusted p-value(통계적 유의성)를 보여줍니다.

플롯 읽는 법

• 상향 조절된 유전자(Upregulated genes)(빨간 점)는 플롯 오른쪽에 나타납니다. 양의 fold change를 가지며 p-value와 fold change 임계값을 모두 통과합니다.
• 하향 조절된 유전자(Downregulated genes)(파란 점)는 왼쪽에 나타납니다. 음의 fold change를 가지며 두 임계값을 모두 통과합니다.
• 유의하지 않은 유전자(Non-significant genes)(회색 점)는 플롯의 중앙 및 하단 부근에 모여 있습니다.

플롯 제목에는 유의한 유전자의 총 개수가 포함됩니다(예: "Significant: 2526"). 플롯의 주석 레이블은 왼쪽에 하향 조절된 유전자 수(예: "n=618"), 오른쪽에 상향 조절된 유전자 수(예: "n=1908")를 보여줍니다.

Threshold Lines

수직 점선은 log2 Fold Change 임계값(양수 및 음수)을 표시하고, 수평 점선은 adjusted p-value 임계값을 표시합니다. 사이드바 Filters 섹션에서 이 값들을 조정할 수 있습니다. 이 선들의 스타일과 색상은 Appearance 섹션의 Threshold Lines 컨트롤을 사용하여 변경할 수 있습니다.

Genes — All (Expandable Table)

Volcano plot 아래의 "Genes — All"로 표시된 확장 가능한 섹션은 모든 발현 통계를 포함한 전체 유전자 수준 데이터 표를 제공합니다.