Circos — Circular Differential Expression View¶

화면 헤더: Circos: Circular Differential Expression Visualization

Circos 리포트는 여러 지표를 동심원 형태의 여러 링으로 겹쳐 보여 주는 간결한 전체 실험 원형 뷰로, Plotly로 인터랙티브하게 렌더링됩니다.

Rings¶

바깥쪽 링(Outer ring) — 유전자의 log2 Fold Change 값으로, 방향(Up / Down)에 따라 구분됩니다.
중간 링(Middle ring) — −log10(padj) 유의성.
안쪽 링(Inner ring) — 선택적으로 표시되는 GO/KEGG enrichment term.
중심(Center) — 연결선이 관련된 유전자/term을 서로 이어 줍니다.

언제 사용하나요

하나의 대비(contrast)에 대해 변화 크기, 유의성, enrichment를 한눈에 요약하는, 발표에 바로 쓸 수 있는 단일 그림이 필요할 때 Circos를 사용하세요. 리포트나 슬라이드의 대표 시각 자료로 유용합니다. 유전자별 정확한 값이 필요하다면 대신 Volcano 또는 Gene Card를 사용하세요.