Hub Network — Hub Genes & Ego-Networks

화면 헤더: Hub Gene Network Visualization

Hub Network 리포트는 공동 발현 네트워크에서 가장 많이 연결된 유전자를 식별하고, 그중 하나를 선택해 주변 이웃(neighborhood)을 살펴볼 수 있게 합니다.

What It Does

• 정규화된 count로부터 공동 발현 네트워크를 구축합니다(외부 API 불필요).
• 가중 연결 정도(weighted degree)를 기준으로 유전자 순위를 매겨 후보 허브 유전자를 드러냅니다.
• 선택한 허브를 중심으로 한 집중된 ego-network를 렌더링합니다 — 직접 연결된 이웃, 이들을 잇는 상관관계 edge, 그리고 허브의 발현 및 기능 세부 정보를 보여줍니다.

노드 크기, 라벨 색상, edge 색상은 사이드바 Appearance 설정을 따릅니다.

When to use it

Hub Network는 유력한 핵심 조절인자 또는 마커, 즉 다른 많은 유전자와 높은 수준으로 공동 발현되는 유전자를 찾고 그 직접적인 공동 발현 이웃을 탐색하는 데 사용하세요. 전체 네트워크 뷰를 보려면 Co-expression과 함께 사용하세요.