GO — Gene Ontology Enrichment¶

화면 헤더: GO: Gene Ontology Enrichment

GO 탭은 Gene Ontology enrichment 분석 결과를 보여 주며, 차등 발현 유전자(DEG) 사이에서 어떤 생물학적 기능, 세포 내 위치, 분자 활성이 과대표(over-represented)되어 있는지 나타냅니다.

GO-Specific Controls¶

GO 탭에는 전역 사이드바 필터에 더해 차트 위에 나타나는 컨트롤이 있습니다. 대비(contrast)는 사이드바의 Contrast 드롭다운으로 결정되며, 사이드바 대비를 전환하면 GO 리포트가 자동으로 갱신됩니다.

Direction¶

발현 방향으로 필터링하는 드롭다운입니다.

up — 상향 조절된(upregulated) 유전자에서 enrichment된 GO term을 표시합니다.
down — 하향 조절된(downregulated) 유전자에서 enrichment된 GO term을 표시합니다.
all — 모든 차등 발현 유전자에서 enrichment된 GO term을 표시합니다.

Ontology¶

표시할 Gene Ontology 도메인을 선택하는 드롭다운입니다.

BP — Biological Process(유전자가 관여하는 생물학적 활동)
CC — Cellular Component(유전자 산물이 세포 내에서 위치하는 곳)
MF — Molecular Function(유전자 산물이 수행하는 분자 활성)

Top N terms¶

사이드바의 Top N 슬라이더로 제어합니다(범위: 5–50, 기본값: 20). 차트에 표시되는 GO term의 개수를 결정합니다.

GO Enrichment Bar Chart¶

주요 시각화는 각 막대가 하나의 GO term을 나타내는 가로 막대 차트입니다. x축은 Gene Count(해당 term에 주석된 차등 발현 유전자의 수)를 나타내고, 막대는 -log10(p.adjust)에 따라 색이 지정됩니다. 이는 통계적 유의성을 나타내는 색상 스케일로, 색이 진할수록 더 유의미한 enrichment를 의미합니다.

차트 제목은 현재 선택 사항을 동적으로 반영합니다(예: "GO Enrichment — skin | up | BP (Top 15)").

GO Enrichment Table (Expandable)¶

차트 아래의 확장 가능한 GO Enrichment Table은 차트의 기반이 되는 전체 표 형식 데이터를 제공하며, GO term ID, 설명, gene count, p-value, adjusted p-value를 포함합니다.