Enrichment Compare — Cross-Contrast Enrichment Heatmap¶
화면 헤더: Enrichment Compare: Cross-Contrast Enrichment Heatmap
Enrichment Compare 탭은 여러 대비(contrast)에 걸쳐 GO 또는 KEGG enrichment 유의성을 비교하는 heatmap을 표시합니다. 이를 통해 어떤 생물학적 pathway나 term이 여러 비교에서 일관되게 enrichment되는지 또는 특정 비교에만 고유한지를 손쉽게 파악할 수 있습니다.
Requirements¶
이 탭을 사용하려면 프로젝트에 enrichment 데이터(GO 또는 KEGG)를 가진 대비가 최소 2개 이상 있어야 합니다.
Controls¶
| Control | Description |
|---|---|
| Database | GO 또는 KEGG enrichment 데이터 선택 |
| Direction | 조절 방향으로 필터링: up, down, all |
| Top terms per contrast | 대비당 포함할 상위 유의미 term의 개수(5–30, 기본값: 10) |
| Ontology | (GO 전용) ontology 범주로 필터링: Biological Process(BP), Cellular Component(CC), Molecular Function(MF) |
유의성 판단에는 사이드바 Filters 섹션의 adjusted p-value 임계값이 사용됩니다.
Heatmap¶
heatmap은 각 term에 대해 대비별로 -log10(adjusted p-value)를 표시합니다.
- 행(Rows) = enrichment term(평균 유의성 순으로 정렬)
- 열(Columns) = 대비(contrast)
- 색상 진하기(Color intensity) = 값이 높을수록(더 유의미할수록) 더 진합니다
- 색상 구성(Color scheme)은 방향에 맞게 조정됩니다. Up은 사이드바의 "Up" 색상을, Down은 사이드바의 "Down" 색상을 사용하며, "all"은 노랑-빨강 스케일을 사용합니다
- 높이(Height)는 term 개수에 따라 자동으로 조정되며, 사이드바의 Plot Height를 최솟값으로 준수합니다
Comparison Matrix (Expandable)¶
heatmap 아래의 확장 가능한 테이블은 모든 term에 대해 대비별 원본 -log10(p.adjust) 값을 보여 줍니다. 추가 분석을 위해 CSV로 다운로드하세요.
Tip
동일한 ontology 범주(예: Biological Process)를 여러 대비에 걸쳐 비교하면, 실험 조건 간에 공유되거나 고유한 생물학적 주제를 파악할 수 있습니다.