Troubleshooting & FAQ

Q: 로그인하려고 할 때 "Invalid credentials"가 표시됩니다. : Liragen에서 제공한 올바른 사용자 이름과 비밀번호를 입력하고 있는지 다시 확인하세요. 자격 증명은 대소문자를 구분합니다. 문제가 계속되면 Liragen 지원팀에 문의하여 자격 증명을 확인하거나 재설정하세요.

Q: Project 드롭다운에서 프로젝트에 "- Not ready"가 표시됩니다. : 이는 RNA-Seq 분석 파이프라인이 여전히 데이터를 처리 중임을 의미합니다. 데이터셋 크기에 따라 다소 시간이 걸릴 수 있습니다. 나중에 다시 확인하세요. 처리가 완료되면 라벨이 사라지고 모든 시각화 탭을 사용할 수 있습니다.

Q: 플롯 로딩에 시간이 오래 걸립니다. : 대용량 데이터셋은 렌더링에 몇 초가 걸릴 수 있습니다. 안정적인 인터넷 연결을 확인하세요. 성능이 지속적으로 느리다면 sidebar의 gene ID 또는 gene description 필터로 데이터를 좁혀 보세요. 이렇게 하면 플롯에 그려지는 데이터 양이 줄어듭니다.

Q: Heatmap by Gene에 "showing top 500 by variance"라는 메시지가 표시됩니다. : 데이터셋에 매우 많은 유전자가 포함된 경우 heatmap은 샘플 전체에서 분산(variance)으로 순위를 매긴 상위 500개 유전자로 표시를 자동으로 제한합니다. 가독성을 위한 조치입니다. 특정 부분집합을 보고 싶다면 sidebar 필터를 사용하여 관심 있는 특정 유전자로 좁히세요.

Q: Bar chart에 "Select gene descriptions to filtered in the sidebar to see the bar chart."라고 표시됩니다. : Bar 탭을 사용하려면 먼저 sidebar의 Filter by gene desc 드롭다운에서 하나 이상의 gene description을 선택해야 합니다. 선택을 완료하면 차트가 나타납니다.

Q: 새 분석 프로젝트는 어떻게 만드나요? : sidebar 하단의 New Project 버튼을 클릭하고, 하나 이상의 NCBI BioProject 접근 ID(쉼표로 구분)를 입력하고, 프로젝트 이름을 지정한 후 Fetch를 클릭하세요. 화면의 단계에 따라 샘플에 주석을 달고 contrast를 정의한 다음 Done을 클릭하여 프로젝트를 분석용으로 제출하세요.

Q: 플롯을 내보내거나 다운로드할 수 있나요? : Streamlit 기반 플롯은 호버 툴팁 및 확대/축소 같은 대화형 기능을 지원합니다. 정적 내보내기의 경우 브라우저의 스크린샷 기능을 사용하거나 플롯을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하여 이미지를 저장할 수 있습니다(차트 라이브러리에서 지원하는 경우). 기초 데이터의 경우 각 플롯 아래의 데이터 테이블을 펼쳐 필요에 따라 데이터를 복사하거나 선택하세요.

Q: 사용자 지정한 화면을 동료와 공유할 수 있나요? : 사용자 지정 설정(색상, 필터, 임계값)은 세션별로 적용되며 세션 간에 저장되거나 URL로 공유할 수 없습니다. 각 사용자는 자신의 자격 증명으로 로그인하여 필요에 따라 설정을 조정해야 합니다.

Q: Venn 탭에 "Venn diagram requires at least 2 contrast files."라고 표시됩니다. : Venn diagram을 생성하려면 프로젝트에 최소 2개의 DESeq2 contrast 파일이 필요합니다. contrast가 하나뿐인 프로젝트는 이 기능을 사용할 수 없습니다.

Q: PPI 탭에 해당 organism이 STRING에서 사용할 수 없다고 표시됩니다. : STRING DB는 모든 organism을 다루지 않습니다. 비모델 organism(예: sweet potato)의 경우 가까운 모델 organism(예: Arabidopsis thaliana)을 입력해 보세요. 또는 외부 데이터베이스 없이 모든 organism에서 작동하는 Co-expression 탭을 사용하세요.

Q: 어떤 브라우저가 지원되나요? : Liragen Insights는 최신 브라우저인 Google Chrome, Mozilla Firefox, Microsoft Edge, Apple Safari에서 가장 잘 작동합니다. 최상의 경험을 위해 브라우저를 최신 상태로 유지하세요.