Upset — Multi-Contrast Intersections

화면 헤더: Upset Plot: Multi-Contrast DEG Intersections

Upset 리포트는 차등 발현 유전자가 여러 contrast에 걸쳐 어떻게 중첩되는지를 한 번에 보여줍니다. 비교 대상이 Venn diagram으로 명확히 표시할 수 있는 수보다 많을 때 사용하는 현대적인 대안입니다.

Reading the Plot

• 막대 그래프(bar chart)는 모든 교집합의 크기(각 contrast 조합에 몇 개의 유전자가 속하는지)를 보여줍니다.
• 막대 아래의 점 행렬(dot matrix)은 각 교집합에 어떤 contrast가 참여하는지를 나타냅니다.
• 막대는 가장 큰 교집합을 쉽게 찾을 수 있도록 정렬됩니다.

임의의 개수(2개 이상)의 contrast에서 동작하며, Venn diagram이 한계에 부딪히는 경우에도 가독성을 유지합니다.

When to use it

5개 이상의 contrast를 비교하거나 Venn diagram이 너무 복잡해질 때 Upset을 사용하세요. "어떤 조건 조합이 DEG를 공유하며 그 수는 몇 개인가?"에 답합니다. 2–4개 contrast의 경우 Venn이 더 직관적인 경우가 많습니다.