Heatmap by Sample — Sample-to-Sample Correlation

화면 헤더: Heatmap - Sample: Sample-to-Sample Correlation

이 heatmap은 모든 샘플 쌍 간의 Pearson correlation coefficient(VST — Variance Stabilising Transformation — 값 기반)를 보여줍니다. 두 축 모두에 샘플 이름이 나열되고 각 셀에 상관 값이 표시되는 정방 행렬(square matrix)입니다.

색상 스케일은 -1(파란색, 완전한 음의 상관)에서 0(흰색, 무상관)을 거쳐 1(진한 빨간색, 완전한 양의 상관)까지 이어집니다. 잘 설계된 실험에서는 생물학적 반복 샘플(biological replicate) 간 그리고 처리 그룹 내에서 높은 상관(진한 빨간색)이 나타나야 합니다.

이 뷰는 품질 관리에 유용합니다. 이상치 샘플, batch effect, 또는 예상치 못한 그룹화를 드러낼 수 있습니다.

이 heatmap은 사이드바 Appearance 섹션의 Plot Width 및 Plot Height 설정을 따릅니다. 또한 샘플 수가 많을 경우 레이블과 값의 가독성을 유지하기 위해 자동으로 크기를 확대하며(샘플당 150 px), 사이드바 설정 값과 샘플 기반 크기 중 더 큰 쪽을 사용합니다.

Correlation Matrix (Expandable)

heatmap 아래의 확장 가능한 Correlation Matrix 표는 모든 샘플 쌍에 대한 정확한 Pearson r 값을 보여줍니다.