Single-cell Figures — Publication Figure Gallery

화면 헤더: 🖼️ Single-cell Figures

단일세포 RNA-seq 프로젝트에서 제공됩니다.

Single-cell Figures 탭은 단일세포 파이프라인이 생성한 정적 그림을 모아 보여줍니다. 논문과 발표에 사용할 수 있도록 300 DPI로 렌더링되며, 상단 캡션에 해당 프로젝트에서 생성된 그림 수가 표시됩니다.

리포트가 아니라 갤러리이며, 29개 리포트에는 포함되지 않습니다. 29개는 인터랙티브 탭을 가리킵니다.

이 그림들은 인터랙티브 플롯이 아니라 고정된 이미지이므로 사이드바 필터에 반응하지 않습니다. 임계값을 바꾸며 결과가 어떻게 달라지는지 확인해야 할 때는 인터랙티브 탭(Cell Atlas, DEG by Cell Type, Cell Composition)을 사용하고, 인쇄 품질의 그림이 필요할 때 이 탭을 찾으십시오.

샘플 프로젝트 실행 예시입니다.

갤러리 구성

그림은 네 갈래로 나뉩니다.

• 아틀라스 뷰 — 세포 유형별, 클러스터별, 샘플별, 그룹별 UMAP. 동일한 임베딩을 네 가지 방식으로 채색한 그림입니다.
• 품질 관리 — 샘플 전반의 세포 단위 품질을 요약한 QC violin.
• 구성과 마커 — marker dot plot과 세포 유형 구성 그림.
• 세포 유형별 결과 — 검정된 세포 유형마다 하나씩 생성되는 volcano plot(세포 유형과 대조 이름이 함께 표기됩니다. 예: Volcano — Chondrocyte_c0__OA_vs_Normal), 그리고 GO·KEGG 농축 분석 그림과 DEG bar plot.

따라서 volcano plot의 개수는 성공적으로 검정된 세포 유형 수를 따릅니다. 특정 세포 유형이 갤러리에 없는 이유는 Pseudobulk Coverage에서 확인할 수 있습니다.